BioCompute Objects API 服务商替代品（2025）

Bioconductor是一个旨在开发和共享开源软件的项目，专注于生物数据分析的精确性和可重复性。该项目促进了一个包容和协作的开发者及数据科学家社区，使用R统计编程语言，每年发布两次，并拥有活跃的用户社区。

Cybertaxonomy平台是一个开源工具和服务集合，覆盖生物学中描述、分类和命名生物群的全工作流程。它包括分类编辑、数据发布、存储交换、标本收集、描述、野外工作、文献和地理等模块，核心是通用数据模型CDM。平台提供TaxEditor、数据门户、数据服务等组件，支持生物分类学研究。

OmniPath是一个分子生物学先验知识数据库，由Saez Lab和Korcsmaros Lab开发。它整合了100多个资源的数据，包含蛋白质-蛋白质和基因调控互作、酶-PTM关系、蛋白质复合体、蛋白质注释以及细胞间通讯。OmniPath提供多种工具和接口，如R/Bioconductor包OmnipathR、Python客户端和Cytoscape插件，支持用户构建和分析信号网络。

Bioinformatics Answers 是一个提供生物信息学领域问题解答和讨论的平台，包括最新的研究进展、开放问题、工作机会、教程等。用户可以在这里提问、分享知识、交流经验。

CyVerse是一个开源的云基础科学数据管理平台，专注于研究和教育，提供数据存储、计算资源和专业服务，以支持开放团队科学和数据驱动的发现。

CORE（连接存储库）提供世界学术文献的综合书目数据库，收集和索引来自存储库和期刊的研究。据我们所知，它也是世界上最大的全文开放获取研究论文集。CORE 是一家致力于开放获取使命的非营利服务机构，也是开放学术基础设施原则POSI的签署方之一。 我们为全球存储库和期刊网络提供服务，提高可发现性并防止其内容被滥用；使用分散的 PID 使元数据记录具有唯一可识别性和可解析性；通过提供元数据验证、内容管理、丰富和 OA 合规工具，支持数据提供者采用良好的实践；并促进机器访问开放研究。 我们的服务支持广泛的利益相关者以可扩展的方式访问我们庞大而全面的数据集合，特别是研究人员、公众、学术机构、开发商、资助者以及来自不同领域的公司，包括但不限于创新者、人工智能技术公司、数字图书馆解决方案和制药公司。

本公司专注于提供先进的生物信息学服务，主营业务包括生物样本库管理、高通量筛选技术支持以及数据分析解决方案，致力于推动生命科学研究和药物发现进程。

CFDE Information Portal是一个旨在促进发现、重用、整合和分析NIH Common Fund项目产生的多样化数据集的平台，以加速生物医学研究中的新假设生成和发现。